Protein–RNA interactions for Protein: O55070

Dnase1l3, Deoxyribonuclease gamma, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase1l3O55070 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnase1l3O55070 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnase1l3O55070 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnase1l3O55070 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnase1l3O55070 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnase1l3O55070 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnase1l3O55070 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnase1l3O55070 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms