Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Atp10aO54827 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Atp10aO54827 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Atp10aO54827 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Atp10aO54827 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Atp10aO54827 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Atp10aO54827 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Atp10aO54827 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Atp10aO54827 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Atp10aO54827 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Atp10aO54827 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Atp10aO54827 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Atp10aO54827 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Atp10aO54827 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Atp10aO54827 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Atp10aO54827 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Atp10aO54827 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Atp10aO54827 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Atp10aO54827 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Atp10aO54827 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Atp10aO54827 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Atp10aO54827 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Atp10aO54827 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Atp10aO54827 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Atp10aO54827 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Atp10aO54827 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Atp10aO54827 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Atp10aO54827 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Atp10aO54827 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Atp10aO54827 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Atp10aO54827 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Atp10aO54827 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Atp10aO54827 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Atp10aO54827 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Atp10aO54827 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Atp10aO54827 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Atp10aO54827 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Atp10aO54827 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Atp10aO54827 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Atp10aO54827 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Atp10aO54827 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Atp10aO54827 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Atp10aO54827 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Atp10aO54827 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Atp10aO54827 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Atp10aO54827 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Atp10aO54827 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atp10aO54827 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atp10aO54827 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atp10aO54827 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Atp10aO54827 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms