Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc18a3O35304 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc18a3O35304 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc18a3O35304 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc18a3O35304 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc18a3O35304 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Slc18a3O35304 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc18a3O35304 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc18a3O35304 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc18a3O35304 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc18a3O35304 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms