Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trove2O08848 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trove2O08848 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trove2O08848 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trove2O08848 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trove2O08848 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trove2O08848 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trove2O08848 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trove2O08848 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trove2O08848 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trove2O08848 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trove2O08848 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trove2O08848 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trove2O08848 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trove2O08848 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trove2O08848 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trove2O08848 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trove2O08848 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trove2O08848 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trove2O08848 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trove2O08848 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trove2O08848 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trove2O08848 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trove2O08848 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trove2O08848 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms