Protein–RNA interactions for Protein: L7N285

Gm3115, Predicted gene 3115, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3115L7N285 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3115L7N285 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3115L7N285 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3115L7N285 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3115L7N285 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3115L7N285 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms