Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700122O11RikJ3QPW6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700122O11RikJ3QPW6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700122O11RikJ3QPW6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
1700122O11RikJ3QPW6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms