Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp870J3QMA4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp870J3QMA4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp870J3QMA4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp870J3QMA4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp870J3QMA4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp870J3QMA4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms