Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp994J3QM38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp994J3QM38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp994J3QM38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp994J3QM38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp994J3QM38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp994J3QM38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp994J3QM38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp994J3QM38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp994J3QM38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp994J3QM38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp994J3QM38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp994J3QM38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp994J3QM38 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp994J3QM38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp994J3QM38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp994J3QM38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp994J3QM38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms