Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21897J3KMP5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21897J3KMP5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21897J3KMP5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm21897J3KMP5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21897J3KMP5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms