Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Srp72F8VQC1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srp72F8VQC1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp72F8VQC1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srp72F8VQC1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srp72F8VQC1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srp72F8VQC1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srp72F8VQC1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srp72F8VQC1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srp72F8VQC1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srp72F8VQC1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srp72F8VQC1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srp72F8VQC1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srp72F8VQC1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srp72F8VQC1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms