Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApobE9Q414 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ApobE9Q414 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApobE9Q414 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApobE9Q414 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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