Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NbasE9Q411 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NbasE9Q411 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NbasE9Q411 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NbasE9Q411 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NbasE9Q411 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NbasE9Q411 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NbasE9Q411 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms