Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Scaf11E9PZM7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Scaf11E9PZM7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Scaf11E9PZM7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Scaf11E9PZM7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Scaf11E9PZM7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Scaf11E9PZM7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Scaf11E9PZM7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Scaf11E9PZM7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Scaf11E9PZM7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Scaf11E9PZM7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Scaf11E9PZM7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Scaf11E9PZM7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Scaf11E9PZM7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Scaf11E9PZM7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Scaf11E9PZM7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Scaf11E9PZM7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Scaf11E9PZM7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Scaf11E9PZM7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Scaf11E9PZM7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Scaf11E9PZM7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Scaf11E9PZM7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Scaf11E9PZM7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Scaf11E9PZM7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Scaf11E9PZM7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Scaf11E9PZM7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Scaf11E9PZM7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Scaf11E9PZM7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Scaf11E9PZM7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Scaf11E9PZM7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Scaf11E9PZM7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Scaf11E9PZM7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Scaf11E9PZM7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Scaf11E9PZM7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Scaf11E9PZM7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Scaf11E9PZM7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Scaf11E9PZM7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Scaf11E9PZM7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Scaf11E9PZM7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Scaf11E9PZM7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Scaf11E9PZM7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Scaf11E9PZM7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Scaf11E9PZM7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Scaf11E9PZM7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scaf11E9PZM7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms