Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn4E9PX29 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn4E9PX29 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn4E9PX29 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn4E9PX29 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn4E9PX29 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn4E9PX29 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn4E9PX29 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn4E9PX29 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn4E9PX29 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptbn4E9PX29 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn4E9PX29 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn4E9PX29 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn4E9PX29 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sptbn4E9PX29 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms