Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc62E9PVD1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc62E9PVD1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc62E9PVD1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc62E9PVD1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc62E9PVD1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc62E9PVD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms