Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28043E0CXC2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28043E0CXC2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28043E0CXC2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm28043E0CXC2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28043E0CXC2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms