Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm4491E0CX42 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4491E0CX42 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm4491E0CX42 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm4491E0CX42 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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