Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lonrf1D3YY23 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lonrf1D3YY23 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lonrf1D3YY23 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lonrf1D3YY23 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lonrf1D3YY23 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lonrf1D3YY23 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lonrf1D3YY23 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lonrf1D3YY23 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lonrf1D3YY23 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lonrf1D3YY23 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lonrf1D3YY23 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf1D3YY23 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lonrf1D3YY23 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lonrf1D3YY23 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf1D3YY23 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf1D3YY23 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lonrf1D3YY23 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf1D3YY23 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lonrf1D3YY23 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf1D3YY23 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms