Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itga9B8JK39 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga9B8JK39 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga9B8JK39 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga9B8JK39 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga9B8JK39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 385.4 ms