Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Siah3B2RWG3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Siah3B2RWG3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Siah3B2RWG3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Siah3B2RWG3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Siah3B2RWG3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Siah3B2RWG3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Siah3B2RWG3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Siah3B2RWG3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Siah3B2RWG3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Siah3B2RWG3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Siah3B2RWG3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Siah3B2RWG3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Siah3B2RWG3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Siah3B2RWG3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Siah3B2RWG3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Siah3B2RWG3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Siah3B2RWG3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Siah3B2RWG3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah3B2RWG3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah3B2RWG3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms