Protein–RNA interactions for Protein: A9C473

A630010A05Rik, RIKEN cDNA A630010A05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630010A05RikA9C473 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A630010A05RikA9C473 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A630010A05RikA9C473 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A630010A05RikA9C473 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A630010A05RikA9C473 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A630010A05RikA9C473 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms