Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll11A4Q9F4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttll11A4Q9F4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttll11A4Q9F4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll11A4Q9F4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ttll11A4Q9F4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttll11A4Q9F4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms