Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SetxA2AKX3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SetxA2AKX3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SetxA2AKX3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SetxA2AKX3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SetxA2AKX3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SetxA2AKX3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SetxA2AKX3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SetxA2AKX3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SetxA2AKX3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SetxA2AKX3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SetxA2AKX3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SetxA2AKX3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SetxA2AKX3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SetxA2AKX3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms