Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec16aA2AIX1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec16aA2AIX1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec16aA2AIX1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec16aA2AIX1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec16aA2AIX1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec16aA2AIX1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec16aA2AIX1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec16aA2AIX1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec16aA2AIX1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sec16aA2AIX1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms