Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Brwd3A2AHJ4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Brwd3A2AHJ4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Brwd3A2AHJ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Brwd3A2AHJ4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Brwd3A2AHJ4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Brwd3A2AHJ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Brwd3A2AHJ4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Brwd3A2AHJ4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Brwd3A2AHJ4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Brwd3A2AHJ4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Brwd3A2AHJ4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Brwd3A2AHJ4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Brwd3A2AHJ4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Brwd3A2AHJ4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Brwd3A2AHJ4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Brwd3A2AHJ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Brwd3A2AHJ4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Brwd3A2AHJ4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Brwd3A2AHJ4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Brwd3A2AHJ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Brwd3A2AHJ4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Brwd3A2AHJ4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Brwd3A2AHJ4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Brwd3A2AHJ4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Brwd3A2AHJ4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Brwd3A2AHJ4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Brwd3A2AHJ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brwd3A2AHJ4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Brwd3A2AHJ4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Brwd3A2AHJ4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brwd3A2AHJ4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brwd3A2AHJ4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brwd3A2AHJ4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brwd3A2AHJ4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Brwd3A2AHJ4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Brwd3A2AHJ4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Brwd3A2AHJ4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Brwd3A2AHJ4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Brwd3A2AHJ4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Brwd3A2AHJ4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Brwd3A2AHJ4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Brwd3A2AHJ4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Brwd3A2AHJ4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Brwd3A2AHJ4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Brwd3A2AHJ4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Brwd3A2AHJ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Brwd3A2AHJ4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Brwd3A2AHJ4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Brwd3A2AHJ4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Brwd3A2AHJ4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Brwd3A2AHJ4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Brwd3A2AHJ4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Brwd3A2AHJ4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Brwd3A2AHJ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Brwd3A2AHJ4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Brwd3A2AHJ4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brwd3A2AHJ4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brwd3A2AHJ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brwd3A2AHJ4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms