Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ube2dnl2A2AFH2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2dnl2A2AFH2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2dnl2A2AFH2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms