Protein–RNA interactions for Protein: A2A9F4

Kdf1, Keratinocyte differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdf1A2A9F4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdf1A2A9F4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdf1A2A9F4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdf1A2A9F4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdf1A2A9F4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdf1A2A9F4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdf1A2A9F4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdf1A2A9F4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdf1A2A9F4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdf1A2A9F4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdf1A2A9F4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdf1A2A9F4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.6 ms