Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2l1A2A259 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l1A2A259 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l1A2A259 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2l1A2A259 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 435.8 ms