Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms