Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms