Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms