Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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Hoxd9P28357 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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