Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms