Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atxn3Q9CVD2 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Atxn3Q9CVD2 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms