Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Rnf144aQ925F3 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf144aQ925F3 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms