Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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