Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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