Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Hdac5Q9Z2V6 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Hdac5Q9Z2V6 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hdac5Q9Z2V6 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Hdac5Q9Z2V6 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hdac5Q9Z2V6 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hdac5Q9Z2V6 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hdac5Q9Z2V6 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hdac5Q9Z2V6 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hdac5Q9Z2V6 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hdac5Q9Z2V6 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hdac5Q9Z2V6 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hdac5Q9Z2V6 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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