Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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