Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC8.59□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC8.59□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms