Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms