Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp54Q8BL06 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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