Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp1P55194 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp1P55194 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp1P55194 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp1P55194 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp1P55194 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp1P55194 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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