Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ggta1P23336 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ggta1P23336 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ggta1P23336 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ggta1P23336 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ggta1P23336 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ggta1P23336 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms