Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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