Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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