Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms