Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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