Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Traf3ip1Q149C2 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms