Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NcanP55066 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
NcanP55066 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcanP55066 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NcanP55066 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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